Mae cardiau amiibo NFC (Near Field Communication) yn gweithio trwy ddefnyddio sglodyn bach wedi'i fewnosod yn y cerdyn sy'n cyfathrebu â darllenydd NFC, a geir fel arfer mewn dyfeisiau hapchwarae fel y Nintendo Switch neu Nintendo 3DS. Pan ddaw'r cerdyn yn agos at y darllenydd NFC, mae'n anfon signal at y darllenydd, sydd wedyn yn darllen y data sydd wedi'i storio ar y sglodyn.
Mae pob cerdyn amiibo yn cynnwys gwybodaeth unigryw, megis enw'r cymeriad, data gêm, ac weithiau hyd yn oed eitemau neu nodweddion y gellir eu datgloi. Pan fydd y data yn cael ei ddarllen gan y darllenydd NFC, gellir ei ddefnyddio mewn gwahanol ffyrdd, megis datgloi cynnwys, nodweddion neu gymeriadau newydd mewn gêm.
I ddefnyddio cerdyn amiibo NFC, yn syml, mae angen i'r defnyddiwr ddal y cerdyn ger y darllenydd NFC ar eu dyfais, a bydd y data'n cael ei ddarllen a'i brosesu'n awtomatig. Mae'r cardiau wedi'u cynllunio i fod yn fach ac yn gludadwy, gan ei gwneud hi'n hawdd eu cario a'u defnyddio wrth fynd.